法庭调解生效后，双方达成了另一项与调解完全不同的协议

调解协议对你们双方具有约束力如若到时对方不履行你可以就该调解协议或着民事纠纷起诉到人民法院
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法院调解之后，如果双方当事人能达成调解协议的，法院可以制作调解书，经双方签字后对双方有效；如果达不成调解协议的，由法院继续进行案件的审理并作出判决。《中华人民共和国民事诉讼法》第九十七条法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第九十七条《中华人民共和国民事诉讼法》第九十七条调解达成协议，人民法院应当制作调解书。调解书应当写明诉讼请求、案件的事实和调解结果。调解书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章，送达双方当事人。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。《中华人民共和国民事诉讼法》第九十九条调解未达成协议或者调解书送达前一方反悔的，人民法院应当及时判决。